“醫龍”再次歸來！完成了日本第一例Batista手術收入后，由朝田龍太郎（坂口憲二 飾）率領的小隊就被解散了。朝田回到了難民營，繼續他的國際救援。之前任職的明真大學，格局也有所變化。前小組成員伊集院登（小池徹平 飾）、里原美紀（水川麻美 飾）等雖然還留守醫院，但都因醫院的情況精神不佳。
這時，一封不知來歷的郵件發到了前小組成員的手上。郵件的內容是希望重組醫龍小隊。這個信息讓小組的成員都感到既興奮又忐忑。這時一位患者被送到醫院，由龍太郎適時挽救了生命。借此機會，醫龍小隊又再次組建，一切都朝著好的方向發展著。但朝田似乎隱隱感覺著背后有人在操縱著這些事……
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