阿力和貝貝都是優(yōu)秀的科研小潛艇，他們是一對非常好的拍檔，在《潛艇總動(dòng)員》中，他們共同完成了很多次的訓(xùn)練和任務(wù)，這一次，兩個(gè)小家伙將面臨什么樣的神秘而有趣的挑戰(zhàn)呢？ 著名的海洋研究學(xué)家及水下考古考古學(xué)家蘇紅博士擁有四枚加勒比海盜藏在深海中的上古勛章的仿制品，四枚勛章分別代表了智慧、勇氣、友誼和正義。這一天，蘇紅博士召集阿力和貝貝，交代他們?nèi)绻軌蛲瓿梢豁?xiàng)任務(wù)將會(huì)獲贈(zèng)一枚勛章，如果能夠收集齊四枚勛章，小家伙們將獲邀去泉州參加海洋博物館的開幕儀式，并將獲得博士贈(zèng)送的神秘獎(jiǎng)勵(lì)，這讓小潛艇們激動(dòng)不已，躍躍欲試！ 阿力和貝貝和海上摩托艇蛙蛙、寵物猴淘淘、海上單腳滑行艇石頭等小伙伴一起，團(tuán)結(jié)合作、不畏困難，相繼出色完成了地中海埃及女王皇冠搜尋、北冰洋佩斯號(hào)殘骸搜尋、阿拉伯海古城石板搜尋、整合沉船文物保護(hù)的任務(wù)，陸續(xù)獲得博士頒發(fā)的四枚勛章并回到泉州，經(jīng)歷驚險(xiǎn)的搜尋后找到鄭和沉船的船錨，把這珍貴的文物當(dāng)做禮物送給即將開幕的泉州海洋博物館。 小潛艇們不負(fù)眾望完成了蘇紅博士交給他們的所有任務(wù)，蘇紅博士兌現(xiàn)自己的諾言，她安排在泉州海洋博物館開幕式上，燃放了小潛艇形象的煙花作為驚喜獎(jiǎng)勵(lì)。 通過海洋探險(xiǎn)的經(jīng)歷，小潛艇們不僅變得更加成熟、勇敢、團(tuán)結(jié)、合作，還了解到悠久的海洋文明、學(xué)會(huì)了海洋文物保護(hù)等很多有用的知識(shí)，從而成為真正的潛艇小英雄！
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