在本季《超級飛俠12》中，超級飛俠依然會接收來自世界各地小朋友的電話，為小朋友定制他們需要的特別的東西，并將東西送到他們手上。當小朋友們遇到困難，樂迪會請求總部的幫助，超級飛俠將帶來擁有各種屬性的愿望能量球，和小朋友們一起搖身一變成為酷炫的愿望守護者，陪同小朋友一起解決問題。而上一季新登場的三位超級飛俠新成員：恐龍飛機超級飛俠大壯、速食卡車超級飛俠糯糯、高速火車超級飛俠咚咚，也會在這一季中展示他們的過人之處。而當困難升級，超級基地也會變成超級機器人，跟超級飛俠一起陪小朋友們度過難關(guān)。
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